玫瑰的颜色是红的，而矢车菊的颜色则是蓝的。为什么会是这样？近一个世纪以来，科学家一直试图揭开这个谜团。
尽管花儿有着明显不同的颜色，但它们有共同的色素。自1913年以来，这个问题就一直困扰着植物学家。92年前，科学家首先在蓝色的矢车菊中发现了花色素，后来，科学家又在红色的玫瑰中发现了同样的花色素，谜团由此产生，那就是为什么一种花色素会产生两种不同的颜色呢？
关于这个问题有许多理论，也许一种花的细胞中含有不同的PH值，众所周知，酸度影响花的颜色。也许，是由于从土壤中吸引的金属离子不同导致了不同的颜色，如今，日本九州大学的植物学家盐野征明领导的一个科学研究小组发现了新的理论，他们在《自然》杂志上报告说，答案是色素在矢车菊植物的细胞中形成了一种非同寻常的微胞，也叫超分子。这种现象不仅让科学家感兴趣，也让商业花农感兴趣。多年来，他们花费大量金钱和时间试图在不能开出蓝花的植物上培育出蓝色的花朵。醉著名的例子就是研究培育出不裉色的蓝色玫瑰，这种玫瑰中产生一种蓝色的色素，叫飞燕草色素苷，这种物质在飞燕草中能够自然发现，但从来没有在玫瑰中发现这种物质。
日本的科学家发现，矢车菊中的色素形成一个大的分子联合体，这个联合体由6个花色素分子组成，它们又与另一个被称为黄酮的色素结合，然后又与另外4个金属离子结合在一起，其中包括一个铁离子、一个镁离子和两个钙离子。但是在玫瑰中，就没有这种超分子形成，所以同样的色素在这两种花中形成了不同的颜色。
诺维奇的约翰.英尼斯协会的生物学教授凯西.马丁说，日本科学家的这一研究可以打破自然规律，那就是可以在一种植物中加入飞燕草色素苷来得到你想要的蓝色花朵。马丁教授说：人们已经开始尝试把一些不是蓝色的花变成蓝色的，比如康乃馨、玫瑰和菊花等。人们一直认为蓝色只能由飞燕草色素苷形成，这是多年来的教条。日本科学家的研究不是说这种观念是错的，而是说如今似乎有另外的方法可以制造蓝色的花朵，而且是矢车菊那样的蓝色，这种蓝色是真正的蓝色，非常漂亮。
玫瑰花中的色素在矢车菊中也能发现，而这种色素在矢车菊中却形成了美丽的天蓝色，如果发现这种其中的原因就有可能改变培育战略，从而能够培育中蓝色的玫瑰。马丁说：矢车菊和玫瑰中色素的基本化学物质是一样的，是组成化学结构的方法不同才导致了颜色的不同。
玫瑰花没有产生蓝色色素的基因，无法生长蓝色花瓣。虽然玫瑰有5000多年的人工栽培历史，迄今已培育出2500多个品种，但始终没有蓝玫瑰的身影。玫瑰花基因没有生成蓝色翠雀花素所需的黄酮类化合物3'5'-氢氧化酶，因此蓝玫瑰被认为是不可能的，因而英语blue rose(蓝色玫瑰)有不可能之意。近日，日本三得利公司展出了世界上首次培育出的真正的蓝玫瑰。blue rose已成为可能。
蓝玫瑰因其色彩华贵而一直为人们所梦想。近年在国内外热卖的蓝色妖姬便是满足人们愿望的替代品。其价格十分昂贵，一枝蓝色妖姬在国内可卖到300元。但它并不是真正的蓝玫瑰，而是白玫瑰用特殊染色剂溶液浸染而成，因而其色彩虽然漂亮，但人工染料导致鲜花表层细胞死亡，花期短，且花开不大。
人们梦想开发出蓝玫瑰，但都失败了。科研人员利用不同品种杂交，通过抑制红色素培养接近蓝色的玫瑰花，但其中并不含蓝色素，所以还不能称是真正的蓝玫瑰。传统杂交技术培育出的蓝玫瑰，颜色偏紫色或灰色，其颜色来自于红或橙色素，不是艳丽的蓝色。
蓝玫瑰从蓝三叶草中提取蓝色素基因，用基因重组技术改变玫瑰花遗传因子排列，成功地让翠雀花素单独显色，移植基因和紫罗兰色素合成，蓝花基因植入玫瑰花，培植出蓝玫瑰。这株玫瑰的花瓣中所含的色素为蓝色，纯度接近100%。
蓝玫瑰也在玫瑰节上首次向世人展露芳容。与那些争奇斗艳的各色玫瑰不同，这株蓝玫瑰被别出匠心地放置在一个空旷场地，经过长长的隔离带围成的通道，偌大的展厅内单独陈放着这株造型别致的蓝玫瑰，远离缤纷热闹的蓝玫瑰安静地立在透明玻璃罩中。这株世界较早转基因蓝玫瑰，并不如想象中的那样妖艳华丽，它的蓝色接近藕荷色，更显清纯娇媚。以新开发的蓝玫瑰为杂交母体，有望使玫瑰花色更加绚丽多彩，这种蓝玫瑰的基因还可以传给下一代。